杭州电子科技大学微电子研究院坚持“基础研究+产业创新”的科研道路，依托微电子、计算机、网络空间安全等学院多学科深度交叉融合，承担了国家自然科学基金重点项目、国家“863”计划、国家重点研发计划、国家“卡脖子”重大工程、浙江省重点研发计划择优委托项目等，获省部级以上科研奖励10余项，其中“固态存储控制器芯片关键技术及产业化”项目获得2020年国家科技进步二等奖。“创新团队”带头人，微电子研究院院长骆建军教授获2022年何梁何利基金科学与技术创新奖（产业创新奖）。

研究院建有“浙江省固态硬盘和数据安全技术重点实验室”和“浙江省领军型创新团队”，形成了以集成电路设计为核心技术，以数据存储、信息安全、智能计算、材料器件为特色的专业方向。研究院培育了两家准上市企业，近10人次获得国家级、省部级人才荣誉。